ヘルプを書くのは面倒です。わたしは今のところhttp://www.koji27.com/soft/hd/を使っていますが、テキストベースだとリッチテキストタグとも直面することになりますし。
改行までを一段落とする というのは、どうやらリッチテキストの仕様のようですね、ぶら下げインデント*1などの設定をしても、手動改行が入ると勝手に無効になっちゃいます。
そういえば、はてなも一改行ごとに、勝手に段落とされる仕様だし、手動での改行=段落の区切れとして考えるべきなんでしょうか?
本物の(作文などで使われる)文章ならば、手動で改行するなんてことはなく、基本的に改行なんてワードラップだけです。行の途中で改行するときは、段落が変わるとき。
ちょっと前にも(おんぷ村の雑記参照)視覚的に見やすいようにbrを入れるべきか否か、考えてましたが、結局わたしがよくやる、手動で改行を入れるときは、形式段落の変わるときと同じなのかなぁ…、つまりは、やっぱり改行を一つの段落としてみるべきなのかなあ…なんて、今は考えてます。
RPGツクールなんかは、確かにワードラップ以外に手動で改行を入れるべき時はありますが、あんなのは特別な例ですからね。
でも、そうすると、意味段落と形式段落の区別が付かなくなっちゃうんですよね、pのなかにpを入れることはできないし、<div class="section">とかやって区切るのが筋なのかな…。
*1:先頭行はインデントされていないが、それ以降の行(ワードラップした行)はインデントされる状態